電腦冷凍石蠟切片機在切片過程中的擺放位置通常有兩種形式，即直面式和側面式：
　　1.直面式擺放：輪轉式切片機正面面對著實驗者；
　　在整個切片過程中，實驗者視野范圍是大的，便于各種操作的實施，不足之處就是切片開始時切片刀刃與蠟塊間的對接調節比較困難，尤其是對初學者，很容易切壞標本蠟塊。
　　2.側面式擺放：輪轉式切片機帶的輪盤面朝向實驗者；
　　切片開始時的對刀以及調整蠟塊切面的方向相對容易一些，再有切片過程中使用毛筆托舉石蠟帶則更方便一些，不足之處就是切片操作的視野范圍相對要小一些。
　　電腦冷凍石蠟切片機操作步驟：
　　1.插上插頭，打開石蠟切片機電源開關。
　　2.將蠟塊固定于切片機頭上的夾座內，調整到稍離開切片能夠切到的位置上，注意蠟塊組織切面與切片刀口要垂直平行。
　　3.再調整蠟塊組織切面恰好與刀口接觸，旋緊刀架，固定好機頭。
　　4.根據需要調整切片厚度。
　　5.進行修整切片，直到切出完整的大組織切面后，再進行切制。
　　6.使用自動切片時，啟動“SECT”鍵，同時按下“RUN”和“ENABLE”鍵，數字轉盤控制切片速度；手動切片時，用右手轉動切片機手輪，左手用毛筆托起蠟片，協調地進行切片操作。
　　7.切下的蠟帶，一端用鑷子輕輕拉起，應盡可能將切片帶拉直展開，用毛筆將蠟帶從刀口向上挑起，拉下蠟帶，然后輕拖鋪于托盤內。
　　8.切片完成后，清理切片機，登記使用記錄本，打掃衛生。